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Salud y Laboral • 9 min de lectura • Actualizado 2026

Guía Definitiva de Licencias Médicas: Cálculo del Subsidio y Apelación ante COMPIN

Todo lo que necesitas saber sobre el pago del Subsidio por Incapacidad Laboral (SIL), los 3 días de carencia y qué hacer si rechazan tu licencia.

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Enfermarse o sufrir un accidente fuera del trabajo genera incertidumbre no solo médica, sino también económica. En Chile, el Subsidio por Incapacidad Laboral (SIL) reemplaza la remuneración del trabajador mientras dura el reposo médico, pero su cálculo y los trámites de tramitación están regulados por normas estrictas del DFL N° 44 del Ministerio del Trabajo.

1. ¿Cómo se calcula el monto a pagar por la licencia?

El monto diario del subsidio se calcula tomando el promedio de las remuneraciones netas (líquidas imponibles) percibidas por el trabajador en los tres meses calendarios anteriores al mes en que se inicia la licencia médica, dividido por 90.

Fórmula Oficial del Subsidio Diario (DFL 44):

Subsidio Diario = (Sueldo Neto Mes 1 + Sueldo Neto Mes 2 + Sueldo Neto Mes 3) / 90 días

Nota: El cálculo considera el tope imponible de salud vigente (90.0 UF). Si tu sueldo supera ese límite, el cálculo se ajusta al tope legal.

2. La Regla de los 3 Días de Carencia (Menos de 11 días)

Una de las mayores fuentes de confusión entre los trabajadores es por qué a veces no pagan los primeros días de reposo. La ley establece una regla matemática clara:

Duración de la Licencia Días Pagados por Fonasa / Isapre Efecto en el Sueldo
De 1 a 10 días corridos Se descuentan 3 días (Carencia) Ej: Licencia de 7 días se pagan solo 4 días.
De 11 días en adelante 100% de los días desde el día 1 Ej: Licencia de 15 días se pagan los 15 días completos.

3. Plazos fatales para entregar la licencia médica

El trabajador tiene la obligación de presentar la licencia médica a su empleador dentro de los plazos legales, contados en días hábiles desde el inicio del reposo:

4. ¿Qué hacer si Fonasa o tu Isapre rechaza la licencia?

El rechazo por causales como "falta de justificación médica", "reposo desproporcionado" o "fuera de plazo" es muy frecuente. Para revertirlo, debes seguir la vía administrativa:

  1. Apelación ante la COMPIN (Comisión de Medicina Preventiva e Invalidez): Tienes un plazo de 15 días hábiles desde la notificación del rechazo de la Isapre para ingresar tu reclamo en milicenciamedica.cl adjuntando informe médico ampliado, exámenes y recetas.
  2. Apelación final ante la SUSESO (Superintendencia de Seguridad Social): Si la COMPIN mantiene el rechazo, tienes 6 meses para presentar un recurso de reposición ante la SUSESO en suseso.cl con ClaveÚnica. La resolución de la SUSESO es vinculante y de cumplimiento obligatorio para la aseguradora.
Preguntas Frecuentes

Dudas habituales resueltas

¿Quién me paga el sueldo cuando estoy con licencia médica?

El empleador no paga sueldo por los días de reposo. El pago lo efectúa directamente Fonasa (a través de la Caja de Compensación asignada o BancoEstado) o la Isapre del afiliado.

¿Me pueden despedir mientras estoy con licencia médica?

No. El Código del Trabajo prohíbe el despido por necesidades de la empresa (Art. 161) mientras el trabajador se encuentre gozando de licencia por enfermedad común, accidente o maternidad. Solo se permite el término por vencimiento del plazo o conclusión de la obra.

¿Debo pagar imposiciones de AFP y Salud durante la licencia?

La entidad pagadora del subsidio (Fonasa, Isapre o Caja de Compensación) descuenta y paga automáticamente las cotizaciones previsionales de AFP y Salud sobre el monto del subsidio, manteniendo tu cobertura al día.

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